就这样，宇智波一族再次被木叶重用，宇智波族人自然欣喜不已，最起码，他们知道了自己存在的价值，感觉到了，木叶村也是他们的家，在这个家中他们也有说话权。

只是，好景不长，二代担心宇智波实力渗透进木叶高层，便逐步将担任高层的宇智波一族解任，最后只保留了宇智波镜警署总长的这一职位。

真的，二代的多次质疑与不信任让镜心中痛苦万分，但是为了宇智波一族，他还是忍了下来。

到了第二次忍界大战，二代被水之国忍者围困，最终在与金角银角的埋伏中身死，临危受命的猿飞出任第三代火影。回到木叶村，木叶高层怀疑二代遭到埋伏是因为有人与水之国沟通，出卖机密，导致二代身死，最后彻查，木叶高层将目标对准了宇智波一族，认为是宇智波一族和敌人勾结，出卖火影，背叛木叶村！

可是，这也仅仅是猜测，当时，并没有任何证据指向宇智波一族，所以，事情就此作罢，但是，木叶村对于宇智波一族的猜忌和怨恨却是更加深刻了，隐隐中，将宇智波一族看做了眼中钉，看做了背叛木叶的犹大之流。

宇智波一族中，木叶的不公平对待与敌视让宇智波族人很是不满，他们明明什么都没做，却还是让人猜忌，就算牺牲了那么多，木叶对待他们的态度仍然像是对待叛徒一般。

身为族长，镜极力调和着宇智波一族和木叶的关系，所幸的是，镜和猿飞也算同窗，而且，他们之间的关系还算不错，而且，三代为人正直，丝毫没有小心眼，到了他这里，总算没有对宇智波一族做出过分之事。

天有不测风云，宇智波镜却被人暗杀致死，这次事件，再次成为了宇智波一族和木叶村之间的导火线，宇智波一族怀疑镜是被木叶暗杀，所以便准备发动暴乱替镜报仇，并且，其他凭借此次的暴乱结束木叶对于宇智波的压制，推翻木叶政权，让宇智波成为木叶的职权者。

暴乱自然没有成功，三代雄才大略，武不用兵，凭借个人魅力化解了这次的暴乱，并且承诺，一定会揪出凶手，为镜报仇。起初，三代确实调查了一番，只是，最后遭到了木叶高层的强大阻挠，甚至，木叶的几个大名同时出面阻止三代的行动，甚至以木叶村来威胁三代，如果再调查下去，他们就不会再支持木叶。

至此，三代总算明白了事情的一切，知道了镜的身亡与木叶高层之间有很大联系，为了不引起木叶村的动荡，三代放弃了调查下去的心思，为了给宇智波一族交代，木叶高层捏造了一个假证据，随便找了个替罪羊