。一边搜罗第二次东江兵变后逃离东江镇的乱卒。以扩充实力。一面转而围攻另一要塞莱州。祟祯五年正月二十八。官军集中山东、保定、天津诸镇在登莱的数万兵力攻打孔有德叛军。双方一场野战。结果。官军大败。几乎形成第二个“萨尔浒”。溃军败回莱州者仅有数百人。山东新任巡抚徐从治。莱州知府朱万年只好据城死战。孔有德乘胜攻城。虽一时难以攻克。但却把由总督刘宇烈、总兵吴安邦等人所率领地官兵援军打得大败。而且还不只是胜了一场。刘宇烈等托大之辈。竟被孔有德率军连连击溃了好几次。而就在刘宇烈等人连战连败地时候。皮岛东江镇总兵黄龙派辽将孙应龙前往援救。结果。孙应龙也中计覆灭。一时间。山东局势糜烂。四月十六日。在莱州城督战的徐从治也被叛军大炮轰毙。

面对如此情境。那些每每高谈阔论。一向自认“天下舍我其谁”地东林分子们十分“明智”的改弦易帜。由原先地竖决进剿变为一意主抚。而关内各军又一向战力薄弱。各线将领都十分畏惧“东江强兵”。也纷纷以朝廷有意招抚为名不敢与孔有德等人决战。结果。被叛军多次利用。祟祯五年七夕。继任的山东巡抚谢琏与朱万成被一支诈降叛军所挟持。意图诈开莱州城门。结果。总兵杨御蕃不顾后果开炮轰击。朱万成人被炸死。

而就在登莱两地大战不已。孔有德一时傲视齐鲁的时候。崇祯五年六月初六日。黄河于孟津决口。军民商户死伤无数。百姓转徙。到处乞食。许多无路可走的百姓开始聚众造反。可是。面对中原大地的遍野饿殍。大明朝廷却根本没什么作为。七月初六。祟祯以太监曹化淳提督京营。加强京师守卫。八月。明廷决心集中大兵进剿山东。以浙江人朱大典接任山东巡抚。太监高起潜监军。率领从关宁军中调来的五千劲卒。合同各地援军共计三万人围剿叛军。孔有德由于几战告捷。过于自负。结果在沙河遭到辽东骑兵（刚刚在大凌河前线临阵脱逃）袭击遭到惨败。损失半数部队。大将陈有时战死。丧失了机动部队的叛军不得不退守根据地登州。莱州总兵杨御蕃由于对东江军恐惧万分。在官军战胜之后。居然还一时不敢开城迎入援军。以至拖延了不少时间。直到太监赶来传令。杨御蕃才敢相信。莱

州终于解围。嘴离被围之时已半年有余。

之后。官军乘胜进围登州。却接连数月不克。不过。孔有德终究只是一旅之师。无法与认真起来的官军长久对抗。守城三个多月之后。叛军都元帅李九成战死。叛军军心逐渐混乱。无奈之下。孔有德放弃登州。一万二千多叛军乘战舰