年7月23日，马库斯博士的复仇计划开始。当天20:00，他指挥水蛭袭击了保护伞公司途经阿克雷山区的列车，成千上万的水蛭落在列车的玻璃上，瞬时冲碎玻璃，车内惨不忍睹。

2小时后，为了解决阿克雷山区的连续杀人事件，浣熊市警局特殊部队S.T.A.R.S的布拉瓦小队，乘坐直升机出动前往阿克雷山区进行调查。但是出发后没多久，布拉瓦小队乘坐的飞机遭受不明武器的袭击坠落，并和浣熊市警局总部失去了联络。布拉瓦小队成员:爱得华·杜威(edwarddewey)26岁，直升机机师。恩里克·马里尼(enricomarini)41岁，副队长，布拉瓦小队队长。福特斯.斯拜尔(forestspeyer)29岁，负债队中的物品整备工作。肯尼恩.j.苏利文(kenneth.j.sulllvan)45岁，负责队中的侦察和防守工作。理查德.艾肯(richardalken)23岁，负责无线电联络。在树林中，瑞贝卡.查姆博斯发现一辆被严重毁坏的宪兵车，车上宪兵死状凄惨无比。比利已经逃走。恩里克命令就地搜索。在搜索中，瑞贝卡看到了那列被袭击的火车，决定进去调查。在列车里，瑞贝卡和比利相遇。介于情况不明并且十分危险,比利提出合作，瑞贝卡只得勉强答应。除了队长恩里克，其他人都已死亡。威斯克和威廉.帕肯在干部培训所指示deltateam队员把列车开走并装毁它，列车一头撞向封闭的隧道。瑞贝卡和比利从列车里逃了出来，却发现这里是干部培训所。这时，马库斯通过监视器告诉威斯克和威廉.帕肯说要进行报复，威斯克和威廉.帕肯意识到安布雷拉将大势已去，脱离安布雷拉的时机已经成熟。两人商量着对策，威廉.帕肯说“T病毒”接近完成，剩下的就是“G病毒”的强化工作，而威斯克则要按原计划把S.T.A.R.S引到洋馆，于是两人离开了干部培训所。

瑞贝卡和比利在干部培训所里遇到重重困难，但在两人齐心协力下一一排除，其间比利还救过瑞贝卡，瑞贝卡发现比利并不象报告上所说的那样凶残，便问起比利是否真的杀了23个人。比利说那是在一次执行非洲内战的任务，他们在行进途中死伤惨重，由于情报的错误，到达目的地时，发现并没有敌人，付出了这么大的代价，为了有所交代，队长命令他向平民开枪，至于他有没有开枪，他却不愿说起。两人继续分头行动，瑞贝卡消灭掉一个暴君试作型，并和比利来到一个步满了水蛭的大房间。原来马库斯正在等着他们，马库斯说要把世界变