雪利尔爬进通向下水道的路时,那个巨大的怪物也就是威廉.帕肯从她们头顶上的走廊经过,雪莉失足落入了下水道的二层。在那里,威廉.帕肯终于找到雪莉。在她昏迷时给雪莉感染上了“G病毒”,于是离去。
克莱尔在寻找雪利尔途中,巧遇雪利尔的母亲安耐特,当她得知克莱尔在一直帮助雪利尔的时候,向克莱尔讲述了灾难的经过,这时,从远处传来了雪利尔的一声尖叫,两人急忙分头寻找,在隧道里,克莱尔找到昏迷的雪利尔。克莱尔一路保护着雪利尔,达到一个车厢内,雪莉感到不舒服,克莱尔感到事情不妙。就在这时,那只人形怪物——威廉出现了,经过艰苦的打斗,怪物被成功地击倒了。
艾达和里昂早先也与威廉战斗过,艾达受伤,里昂将她安置好,一个人先打探出路。返回时艾达已经不见了。里昂继续前进,不巧又碰见了安耐特,安耐特以为里昂是安布雷拉的间谍,还告诉里昂那个叫艾达的女子以找男朋友为借口,其实她也是间谍!里昂不相信。安耐特为报仇,要杀里昂,突然屋子上方的一阵震动将几个大铁管子震了下来,安耐特被砸昏了。里昂从她身上找到了使全镇人疯狂的“G病毒”。里昂乘坐那里的高速列车准备离开这里,但这时艾达出现,并要里昂交出“G病毒”,原来她果真是间谍!里昂不肯,两人这样僵持着。最后,艾达屈服了,放下了手里的枪。就在他们准备利用地下研究所逃生列车离开浣熊市的时候,安布雷拉空投下来的一个tyrant(暴君·改t-002型)出现在里昂面前,为了掩护里昂,艾达被tyrant杀死,翻身掉下铁桥,研究所自毁装置也因tyrant对艾达的致命一击而启动。里昂消灭了tyrant,伤心之极,拿出那支“g病毒”,将它抛向了空中。不久,“G病毒”被幸存者汉克找到,并成功收回。
过了一段时间,安耐特又在别处遇见克莱尔。她想使用研制成功的疫苗将自己的丈夫变回人类。但是,由于威廉已经失去了人性,安耐特被威廉变异的手指杀死。克莱尔从安耐特的手里拿到了疫苗合成方法,于是决定为雪利尔配一支。在撤离途中,大怪物——威廉不依不饶,一定要干掉与靠近雪利尔的人,他从g1变到g3形态,最终还是被克莱尔轰倒。在同时,里昂找到了逃出基地的火车,在和暴君最终形态单挑时,艾达的身影出现并给他扔下一枚救命火箭筒结束了这场战斗。里昂,克莱尔,雪莉乘上火车,却被变异的威廉困在车上,最终火车爆炸,三人逃出了研究所。克莱尔的下一步是去找哥哥。
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