马曰磾为太傅，总领尚书台，任杨彪为太尉，任蔡邕为司空，征召在邺城避难的卢植任司徒，三公之位彻底换了一遍，皆为大有名望之人。丁原则官复原职，继续领执金吾之位，不仅如此，马超还以天子的名义下诏召司隶校尉袁绍和议郎曹艹等诸侯来京任职。

袁绍和曹艹接到诏书后面色沉重，却无人敢来赴任，马超此举可谓用心险恶啊！挟天子以令诸侯之心谁人不知，谁人不晓。但他们也不敢明面上造反，纷纷找各种理由推脱。

马超对此也不在意，此举只不过想让他们承认这个朝廷罢了，想凭一个名存实亡的朝廷命令各方诸侯显然是不现实的事情。但有了这位天子在手，他行起事来名正言顺，如教化、改革、征讨不臣、招揽人才都可以打着天子的旗号进行，可谓好处多多。

接着马超又以天子的名义宣布放逐董贼余孽之事，在渤海郡造船五十余艘，雇佣当地水手，送李儒、李傕等人携着家眷领兵两万东渡而去。袁绍本来还想借此事联合天下诸侯出兵讨伐马超，那想到马超这一出戏彻底打乱他的计划，想出兵也找不到借口！

而马超送走李儒的同时还收编了三万西凉军，其中还有不少羌兵，皆为精锐之士。马超这次倒是信守承诺，不但一个没杀，连老弱病残之辈都给安排了相应的工作，如火头军，辅兵，地方捕快等等。同时，也向他们发出了最后的警告，如再敢行烧杀银掠等不法之事，定斩不饶。

如此一来，马超麾下大军达到三十万之多，几乎全部经过战火的洗礼，百战精锐之士也足有一半之多。但军中编制混乱不堪，主要有西凉军，并州军，黑山军、冀州郡兵以及南匈奴骑兵，军制改革迫在眉睫。

趁此短暂的和平，马超又将各地主要将领召至洛阳商议军制改革一事。其实，对此事他早就有了初步的想法，只是没有公布于众罢了。

当时，大汉实行征兵免税制度，只要家中有壮丁参军便可免除部分赋税。而军中只有高级将军才有月俸，普通的军士只是象征姓的发一些月钱，连自己都养活不了，更别说养家糊口了。

东汉军制五人一伍，有伍长。十人一什，有什长。五十人一队，有队率。百人一屯，有屯长。二百人一曲，有军侯。千人一部，有司马或校尉，校尉为正、司马为副。

马超在此基础上又加了两个职位，五千人为一师，有裨将军统领。万人为一军，由偏将军统领。万人以上者为一军团，只有偏将军以上的军职人员才有资格统领。

同时，还首次在军中加入军衔制度，军衔与职位无